一、 灭活苗：
灭活疫苗是先对病毒或细菌培养，然后用加热或化学剂（通常是福尔马林）将其灭活。灭活疫苗即可由整个病毒或细菌组成，也可由它们的裂解片段组成为裂解疫苗。裂解疫苗的生产，是将微生物进一步纯化，直至疫苗仅仅包含所需的抗原成分。它既可以是蛋白质疫苗，也可以是多糖疫苗。蛋白质疫苗包括类毒素（灭活细菌毒素）和亚单位疫苗。大多数多糖疫苗由来自细菌纯化的细胞壁多聚糖组成；结合疫苗是将多糖用化学方法与蛋白质连接而得到的疫苗，从而成为更有效的疫苗。
灭活疫苗常需多次接种，接种1剂不产生具有保护作用的免疫，仅仅是“初始化”免疫系统。必须接种第2剂或第3剂后才能产生保护性免疫。它引起的免疫反应通常是体液免疫，很少甚至不引起细胞免疫。接种灭活疫苗产生的抗体滴度随着时间而下降，因此，一些灭活疫苗需定期加强接种。灭活疫苗通常不受循环抗体影响，即使血液中有抗体存在也可以接种，它在体内不能复制，可以用于免疫缺陷者。
灭活疫苗使受种者产生以体液免疫为主的免疫反应，它产生的抗体有中和、清除病原微生物及其产生的毒素作用，对细胞外感染的病原微生物有较好的保护效果。灭活疫苗对病毒、细胞内寄生的细菌和寄生虫的保护效果较差或无效。
在生产应用时使用灭活疫苗的主要目的在于引导一致、高水平、长时间免疫应答反应，
但其缺陷也是很突出的，往往没能产生较好的粘膜免疫，所以往往免疫ND和传支的时候，要配合活疫苗加强局部免疫。灭活苗接种时遗漏或注射不当的鸡一般不会有接受补充接种的机会。
灭活疫苗的优点：使用安全；易于保存；无污染危险；对母源抗体的中和作用不敏感；容易制成联苗或多价苗。
灭活苗的缺点：接种剂量大；免疫期短；免疫途径单一；主要激发体液免疫。
关于灭活苗的剂量方面：最好根据厂家的建议确定剂量，一般首免是无需加大剂量使用的 ，合理的剂量才是最重要的，过大的剂量会造成浪费，过大剂量会造成接种部位发炎，导致鸡群接种疫苗应激加剧，且影响疫苗的应答。
二、 活疫苗：
活疫苗是指将细菌或病毒在人工条件下促使其变异，失去致病性但保留免疫原性和繁衍能力和剩余毒力，接种后在动物体内有一定程度的繁殖或复制，类似一次轻型的自然感染过程，但不会导致动物发病。
活疫苗接种后在体内有生长繁殖能力，接近于自然感染，可使机体发生类似隐性感染或轻度感染的反应，可激发机体对病原的持久免疫力，但不产生临床症状，免疫效果强而持久，一般只需接种一次，且用量较小，除刺激机体产生细胞免疫和体液免疫外，还可以产生局部免疫保护。
活疫苗用量较小，免疫持续时间较长。活疫苗的免疫效果优于死疫苗。
由于活疫苗是将病毒、细菌等病原体经过减毒等方法制备而成，因此在接种疫苗后有可能出现接种反应
活疫苗的优点： 诱导体液免疫和细胞免疫两种免疫反应，使机体获得较广泛的免疫保护； 由于使用的是活的微生物，它们可以在机体内长时间起作用而诱导较强的免疫反应；接种数量少不影响动物品质；能引起水平传播，扩大免疫效果、增强群体免疫屏障；不需添加佐剂、不需浓缩纯化；价格低廉；多种免疫途径。
弱毒活疫苗的缺点：由于是活的微生物制剂，可能会造成环境污染形成传染源；可能出现毒力回交，即“反祖现象”；活疫苗须在低温条件下保存及运输，有效期相对较短；可能无意保留了一些活的病原体，经接种途径人为传播疫病，如经过污染的马立克疫苗接种而引起禽网状内皮增生等病的爆发。
三、以上两种疫苗都是全微生物疫苗，即经典疫苗。将两种疫苗结合使用，优势互补。
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