2018年3月13日国务院机构改革方案提请全国人大审议。改革后，除国务院办公厅外，国务院设置组成部门26个。令环保人瞩目的是不再保留环境保护部，改组生态环境部！
根据改革方案，将组建生态环境部，将环境保护部的职责，国家发展和改革委员会的应对气候变化和减排职责，国土资源部的监督防止地下水污染职责，水利部的编制水功能区划、排污口设置管理、流域水环境保护职责，农业部的监督指导农业面源污染治理职责，国家海洋局的海洋环境保护职责，国务院南水北调工程建设委员会办公室的南水北调工程项目区环境保护职责整合，组建生态环境部，作为国务院组成部门。生态环境部对外保留国家核安全局牌子。
同时我们还看到新组建了自然资源部。为统一行使全民所有自然资源资产所有者职责，统一行使所有国土空间用途管制和生态保护修复职责，着力解决自然资源所有者不到位、空间规划重叠等问题，实现山水林田湖草整体保护、系统修复、综合治理，方案提出，将国土资源部的职责，国家发展和改革委员会的组织编制主体功能区规划职责，住房和城乡建设部的城乡规划管理职责，水利部的水资源调查和确权登记管理职责，农业部的草原资源调查和确权登记管理职责，国家林业局的森林、湿地等资源调查和确权登记管理职责，国家海洋局的职责，国家测绘地理信息局的职责整合，组建自然资源部，作为国务院组成部门。自然资源部对外保留国家海洋局牌子。
之前，我国的环保职能被多部门分割，污染防治职能分散在海洋、渔政、交通等部门，资源保护职能分散在矿物、农业、林业、水利等部门，调控管理职能分散在财政、发改委、工信、国土等部门。现实当中环境执法阻力重重，在涉及其他部门权责时会遭遇推脱、‘踢皮球’的情况。对企业团体执法时，当事人以环保部门无权监管而横加阻拦。要构建一个以生态文明建设为主旨，改善生态环境为导向，监管统一、职权明确、执法严明的环境监管部门，着力解决污染防治能力弱，监管职能交叉权责不一致，违法成本低等问题，新组生态环境部不再保留环保部正是对环保工作大刀阔斧的改革，也是对日后生态文明建设和环境保护工作的有力保证。
同时我们看到生态环境部在原环保部的基础上新增了几项规划的职责，环保时评认为，经济发展离不开发展规划，而从规划源头上将环境保护意识注入到发展理念当中，这正是从根本上对生态环境保护与可持续发展的一种保证。生态文明建设不是一朝一夕能够完成的，它是一项依靠长期、系统、科学的规划为指导的战略性进程。我国规划种类繁复多样，涉及生态文明的规划有生态规划、自然保护规划、污染防治规划、国土规划等。最早涉及生态环境类规划是在60、70年代的国民经济和社会发展规划，而当时的规划因追求经济效益很少考虑生态环境问题，把污染与生态环境只看成一个孤立于经济、社会的事物，没有从相互联系和整体上予以考虑。随后，经济发展与生态环境的矛盾不断呈现，让人们意识到保护环境的重要性而开始制定各类有关于保护生态环境的规划。但各个规划因规划对象、目的、性质的不同，经常出现彼此相悖、重复规划、与实际情况不配套的情况。
希望新的生态环境部以污染综合防治规划为手段，针对工业生产、居民生活等所产生的污染，规定防治目标和具体减排措施，做到预防为主、总量控制，推行各类环境质量标准。解决环境污染是生态文明建设的重中之重，在编制总体规划是应予以侧重。
环保时评认为虽然此次重组在很大程度上整合了环保工作的组织体系，但还有一部分环保工作放在了自然资源部，自然资源是人类赖以生存的基础，如土地、矿藏、生物等均是自然资源，是生产的原料来源和布局场所。生态文明的首要任务便是维护自然资源的有序开发，做到可持续发展。而我国大部分自然资源产权界定不清楚，宪法规定自然资源归属全体人民和集体所有。实际上，除了林地、土地外，尚未对矿藏、水资源、山区、草原、湿地等自然资产进行统一的确权登记。美国的经济学家Yoram Barzel提出过“产权决定越明确，财富被无偿占有的可能性就越小，产权的价值就越大。”
当自然资源成为没有界定产权的公共资源时，各方势力都会对其进行争夺。导致如水资源、草地、矿藏等被无价或廉价获取，而使用者在追求自身利益的情况下势必会造成自然资源的浪费、掠夺式开发从而导致环境破坏，但使用者却未对此付出应有的代价，所有的环境成本被无视与转移。
还有一小部分的资源保护职能依然分散在农业、林业、水利等部门，小部分调控管理职能分散在财政、发改委、工信、自然资源等部门。希望新部委在日后环境保护的工作中能逐渐磨合，保证生态文明建设的整体性，破除生态文明建设的体制障碍，让天更蓝水更清也正是人民对美好生活的向往。
另外，环保时评认为，生态环境部的各级子系统应当脱离地方政府管辖和财政支出，像法院、海关系统一样进行垂直管理。脱离地方政府后，可以更好地发挥环境监管职能，对各地区环境问题的监管与执法将更权威、高效。解决了区域间的执法差异，避免本地企业与外地环保部门玩‘捉迷藏’，降低执法成本。也能够更好地对跨界污染进行防控与处置。
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